Les départements se caractérisent par leurs disciplines, leurs thématiques et le cas échéant, leurs objets d’étude.

Ils contribuent, pour leurs périmètres, à l’élaboration de la stratégie éducative et scientifique de l’Institut et les traduit en termes opérationnels.

Ils assurent la veille et l’animation dans leurs domaines respectifs.

Les départements se dotent d’une feuille de route annuelle validée par le Président de l’Institut, le « schéma stratégique ». Le schéma stratégique des départements est centré sur les dimensions éducatives et scientifiques, et décliné en termes de compétences et d’activités.